Научно-технологический центр открыт к партнерству с научными организациями и вузами страны по ведущимся в НТЦ направлениям научных исследований, разработке образовательных программ и подготовке кадров.
В настоящий момент Угличская биофабрика сотрудничает с:
- ВНИИ маслоделия и сыроделия (ВНИИМС), который расположен в городе Угличе и входит в ФНЦ пищевых систем им. В.М. Горбатова (ВНИИМС, в частности, занимается разработкой бактериальных концентратов для молочной промышленности и обладает коллекцией из 5 тысяч штаммов микроорганизмов);
- Передовой инженерной школой «Агробиотек» Томского государственного университета (по вопросам подготовки кадров для НТЦ, выполнении передовых исследований).
Готовятся соглашения с другими организациями.
После начала работы биофабрики НТЦ готов принимать на практику студентов профильных вузов и учреждений среднего профессионального образования.