Научный совет НТЦ является консультативным органом, основными задачами которого являются:
- подготовка предложений по развитию перспективных направлений научных и прикладных исследований НТЦ;
- подготовка предложений о развитии научно-лабораторной инфраструктуры НТЦ;
- ежегодная экспертная оценка итогов научной деятельности НТЦ;
- выработка рекомендаций по включению НТЦ в научную кооперацию с профильными академическими институтами и вузами страны.
В Научный совет НТЦ приглашаются ведущие отечественные и зарубежные ученые.
В настоящий момент персональный состав Научного совета находится в стадии формирования.